东京海洋大学是日本唯一特化海洋研究与教育的国立大学。2003年（平成15年）10月由拥有120年以上历史的东京商船大学及东京水产大学合并而成、2004年4月开始以东京海洋大学名义招收本科生。旧东京商船大学长年涌现出了许多支撑日本商船队的水手和海员、与打下水产立国基础的旧东京水产大学一同、至今仍致力于海洋科学与工学专门领域的教育与研究、并以世界标准为目标。
大学学法人本部及海洋科学部设于品川校区、进行海洋环境、生物资源、食品生产、海洋政策文化等研究，海洋工学部设于越中岛校区、进行船舶职员的养成、并且是东日本唯一进行物流领域教育与研究的大学。
东京海洋大学学科设置
海洋科学部（品川校区：东京都港区港南4-5-7）海洋环境学科海洋生物资源学科海洋食品科学学科海洋政策文化学科
海洋工学部（越中岛校区：东京都江东区越中岛2-1-6）海事系统工学科海洋电子机械工学科。流通情报工学科
东京海洋大学大学院专业设置
海洋技术科学技术研究科
海洋生命科学（水圈生物科学、生物资源学、海洋生物工学）、食品机能保全科学（食品品质设计学、保健食品科学）、海洋环境保全学（海洋生物学、水圈环境化学、环境系统科学、环境系统工学、国际环境文化学）、海洋管理政策学（海洋政策学、海洋利用管理学）、海洋系统工学（环境技术学、动力系统工学、海洋机械工学、海洋人工智能、海洋探查·利用工学）、食品流通安全管理。
